Специалист в области физико-химической медицины, молекулярной биологии и биохимии, молекулярной диагностики, геномики, протеомики, системной и синтетической биологии. Широко известен своими работами в области молекулярной диагностики клинически значимых патогенов, системной биологии микроорганизмов, изучения микробиоты человека, имеет более 6,5 тыс. цитирований. Внёс большой вклад в использование научных достижений в теоретической и прикладной медицине.