Область научных интересов и сфера научной деятельности

Ученик и сподвижник академика А. А.Баева, одного из основоположников молекулярной биологии и генетической инженерии в России. 

Специалист в области физико-химической биологии, белковой инженерии и биотехнологии. 

Одним из первых предложил новый подход для изучения структуры белков и их комплексов с ДНК, основанный на использовании приёмов генетической инженерии, химического синтеза олигонуклеотидов и физического анализа структуры биополимеров. 

Им были выполнены Пионерские работы по конструированию и исследованию искусственных белков. 

Совместно с сотрудниками впервые в мире получил белок de novo с заданной структурой и функцией. В настоящее время рабочая группа М. П. Кирпичникова занимается проблемами получения и исследования ряда рекомбинантных белков и пептидов, представляющих интерес для медицины и биотехнологии, изучению их структуры и функции, а также структурно-функциональных отношений в белковых молекулах.

Занимаемые научные и административные должности

Декан биологического ф-та МГУ, заведующий кафедрой биоинженерии биологического ф-та МГУ, заведующий лабораторией инженерии белка Институт биоорганической химии РАН.
Председатель Высшей аттестационной комиссии Министерства образования и науки РФ (2006–2012).

Участие в научных советах, комиссиях, редколлегиях

Член Координационного межведомственного совета по приоритетному направлению "Науки о жизни и биотехнология",
член межведомственной комиссии по проблемам генно-инженерной деятельности,
член межведомственного научного совета РАН и РАМН по фундаментальным проблемам медицины,
член ряда других научных советов РАН и Минобразования науки РФ,
главный редактор биологического Вестника Московского университета,
член редколлегии ряда научных журналов: «Биологическая химия», «Биотехнология», «Наука в России»,
член специализированного Ученого совета по защитам докторских диссертаций Института биологии гена РАН и т. д.
Член Совета по генно-инженерной деятельности при Президиуме РАН и Совета по реализации Федеральной научно-технической программы развития генетических технологий на 2019–2027 годы.

Научно-организационная деятельность

Член бюро ОБН РАН, член Совета РГНФ.

Научно-педагогическая деятельность

Цикл лекций: «Введение в молекулярную биоинженерию» на кафедре биоинженерии биологического факультета МГУ.

Научные публикации

•‎ «Конструирование белковых молекул», Вестник АН СССР, 1988 год.
•‎ «Белковая инженерия искусственных белков», Молекулярная биология, 1996 год.
•‎ «Связывание cro репрессора фага λ с фрагментом оператора», Доклады Академии наук, 1984 год.
•‎ Lipid-protein nanoscale bilayers: a versatile medium for NMR investigations of membrane proteins and membrane-active peptides, J Am Chem Soc, 2008, 130(7).
•‎ Bacterial expression, NMR, and electrophysiology analysis of chimeric short/long-chain alpha-neurotoxins acting on neuronal nicotinic receptors, Journ. Biol. Chem., 2007, vol. 282, № 34.
•‎ Comparative analysis of proapoptotic activity of cytochrome c mutants in living cells, Apoptosis 2005, № 10.

Премии и награды

•‎ Почетная грамота Правительства Российской Федерации (1995).
•‎ Медаль «В память 850-летия Москвы (1997).
•‎ Орден Почета (1998).
•‎ Государственная премия в области науки и техники за работу «Принципы структурной организации белков и их применение к конструированию новых белковых молекул: теория и эксперимент» (1999).
•‎ Медаль «В память 300-летия Санкт-Петербурга» (2003).
•‎ Орден Дружбы (2006).
•‎ Орден «За заслуги перед Отечеством» IV степени (2011).
•‎ Премия имени А.А. Баева РАН (2016) за цикл работ «Рекомбинантные белки как современный инструмент для структурной биологии, биофизики и молекулярной биологии».
•‎ Премия Правительства РФ в области науки и техники 2016 за инновационные технологии промышленного производства биопрепаратов в агропромышленном комплексе РФ (2016).
•‎ Орден «За заслуги перед Отечеством» III степени (2017).
•‎ Премия имени Ю.А. Овчинникова РАН (2021) за цикл работ «Белковая инженерия: управление структурой и функцией белковых молекул» (2021).
•‎ Научная Демидовская премия 2022 г. в номинации «Биоинженерия» за выдающийся вклад в развитие биоинженерии.
•‎ Благодарственное письмо Президента Российской Федерации В. В. Путина в связи с 300-летием Академии (2024).
•‎ Юбилейная медаль «300 лет Российской академии наук», (2024).