Научные интересы

Исследование сложных надмолекулярных систем репликации и репарации ДНК и их вклада в здоровье и долголетие человека. Механизм поли(АДФ-рибозил) ирования, катализируемый PARP1, PARP2 и PARP3, и понимание роли поли(АДФ-рибозы) в регуляции и белок-белковых и белок-нуклеиновых при репарации ДНК является основной областью исследований. 

С группой коллег определила новые белковые мишени для поли-АДФ-рибозилирования, а также открыла принципиально новую функцию ферментов семейства PARP (PARP1/2/3) – способность осуществлять поли-АДФ-рибозилирование ДНК в разрывах. Детально исследован механизм поли-АДФ-рибозилирования, катализируемый ферментами PARP и влияние белков-партнеров PARP на эффективность этого процесса. 

Разработана оригинальная стратегия для выявления новых факторов репликации/репарации ДНК в клеточных и ядерных экстрактах. Этот протеомный подход включает использование химически активных ДНК-интермедиатов репарации ДНК в комплексе с методом MALDI-масс-спектрометрии для идентификации белков в ковалентных аддуктах белок-ДНК. Это позволило обнаружить новые белковые мишени, взаимодействующие с апуриновыми/апиримидиновыми сайтами, а также с разрывами ДНК, и описать их функции в репарации ДНК. 

Разработаны ингибиторы ключевых ферментов репарации, которые находятся в доклинических испытаниях в качестве потенциальных антираковых препаратов. 

Её работы известны мировому сообществу и ее имя внесено в список мировых экспертов в области репарации ДНК.

Научные публикации

•‎ Kurgina TA, Moor NA, Kutuzov MM, Naumenko KN, Ukraintsev AA, Lavrik OI. Dual function of HPF1 in the modulation of PARP1 and PARP2 activities. // Commun Biol. (2021), 4(1), 1259.
•‎ Alemasova EE, Lavrik OI. Poly(ADP-ribosyl)ation by PARP1: reaction mechanism and regulatory proteins. // Nucleic Acids Res. 2019, 47(8), 3811-3827.
•‎ Singatulina AS, Hamon L, Sukhanova MV, Desforges B, Joshi V, Bouhss A, Lavrik OI, Pastré D. PARP-1 Activation Directs FUS to DNA Damage Sites to Form PARG-Reversible Compartments Enriched in Damaged DNA. // Cell Rep. 2019 May 7;27(6):1809-1821.e5.
•‎ Zarkovic G, Belousova EA, Talhaoui I, Saint-Pierre C, Kutuzov MM, Matkarimov BT, Biard D, Gasparutto D, Lavrik OI Characterization of DNA ADP-ribosyltransferase activities of PARP2 and PARP3: new insights into DNA ADP-ribosylation. // Nucleic Acids Res. (2018) 46, 2417-2431.
•‎ Sukhanova MV, Abrakhi S, Joshi V, Pastre D, Kutuzov MM, Anarbaev RO, Curmi PA, Hamon L, Lavrik OI Single molecule detection of PARP1 and PARP2 interaction with DNA strand breaks and their poly(ADP-ribosyl)ation using high-resolution AFM imaging. // Nucleic Acids Res. (2016) 44, e60.
•‎ Talhaoui I, Lebedeva NA, Zarkovic G, Saint-Pierre C, Kutuzov MM, Sukhanova MV, Matkarimov BT, Gasparutto D, Saparbaev MK, Lavrik OI, Ishchenko AA Poly(ADP-ribose) polymerases covalently modify strand break termini in DNA fragments in vitro. // Nucleic Acids Res. (2016) 44, 9279-9295.
•‎ Moor NA, Vasil'eva IA, Anarbaev RO, Antson AA, Lavrik OI Quantitative characterization of protein-protein complexes involved in base excision DNA repair // Nucleic Acids Res. (2015) 43, 6009-6022.
•‎ Khodyreva SN, Prasad R, Ilina ES, Sukhanova MV, Kutuzov MM, Liu Y, Hou EW, Wilson SH, Lavrik OI Apurinic/apyrimidinic (AP) site recognition by the 5'-dRP/AP lyase in poly(ADP-ribose) polymerase-1 (PARP-1) // Proc Natl Acad Sci USA, (2010) 107, 22090-22095.
•‎ Prasad R, Liu Y, Deterding LJ, Poltoratsky VP, Kedar PS, Horton JK, Kanno S, Asagoshi K, Hou EW, Khodyreva SN, Lavrik OI, Tomer KB, Yasui A, Wilson SH HMGB1 is a cofactor in mammalian base excision repair // Mol Cell, (2007) 27, 829-841.
•‎ Sukhanova MV, Khodyreva SN, Lebedeva NA, Prasad R, Wilson SH, Lavrik OI Human base excision repair enzymes apurinic/apyrimidinic endonuclease1 (APE1), DNA polymerase beta and poly(ADP-ribose) polymerase 1: interplay between strand-displacement DNA synthesis and proofreading exonuclease activity // Nucleic Acids Res, (2005) 33, 1222-1229.

Премии и награды

•‎ Орден Дружбы, 2024 г.
•‎ Премия имени Ю. А. Овчинникова, 2024 г.
•‎ Почётное звание «Заслуженный деятель науки НСО», 2021 г.
•‎ Медаль «Памяти академика Н. М. Эмануэля» за достижения в области химической и биохимической физики, 2019 г. 
•‎ Медаль Ордена «За заслуги перед Отечеством» II степени, 2018 г.
•‎ Кавалер Ордена Академических пальм Франции, 2016 г.
•‎ Почётный Доктор Алтайского государственного университета, 2018 г.
•‎ Премия «Академина. Женщина в науке» в честь 55-летия СО РАН.
•‎ Государственная премия СССР, 1984 г.
•‎ Премия Всесоюзного химического общества им. Д. И. Менделеева, 1988 г.
•‎ Лауреат премий Сибирского Отделения РАН, 1985 г., 1986 г., 1988 г., 1990 г.

Персональные профили исследователя

•‎ Web of Science: G-4641-2013.
•‎ Scopus: 35415890900.
•‎ РИНЦ: 641.
•‎ ORCID: 0000-0001-5980-8889.