Васильев А.В. - специалист в области биологии развития, клеточных механизмов развития и регенерации, автор 128 научных работ, в том числе 18 патентов.

Основные научные результаты Васильева А.В. достигнуты в биологии стволовых клеток, исследования механизмов дифференцировки и трансдифференцировки, тканевой инженерии:

- изучены закономерности пролиферации и дифференцировки эпителиальных стволовых клеток, плюрипотентных клеток, клеточные механизмы индукции регенерации


- показана возможность трансдифференцировки постнатальных стволовых клеток в специализированные клеточные типы, выявлены основные механизмы эпителио-мезенхимного перехода и межклеточных взаимодействий, дифференцировки плюрипотентных клеток в эктодермальном и энтодермальном направлениях


- разработаны тканевые эквиваленты ряда тканей и органов (эквивалент кожи, уретры, роговицы, хрящевой ткани), методы восстановления структур и функций тканей и органов трансплантацией тканеинженерных конструкций.
Исследован феномен гистотипической регенерации тканей, в том числе под влиянием аллогенных тканевых эквивалентов.

Васильев А.В. ведет образовательную деятельность, являясь заведующим кафедрой эмбриологии Биологического факультета МГУ имени М.В. Ломоносова
лектором курсов лекций «Биология стволовых клеток», «Актуальные вопросы биологии развития». Под его руководством защищены 9 диссертационных работ на соискание ученой степени кандидата наук
член диссертационных советов при ИБР РАН и при Биологическом факультете МГУ имени М.В. Ломоносова.

Васильев А.В. является экспертом РАН. За заслуги в развитии биологической науки награжден Золотой медалью им. М.А. Лаврентьева СО РАН. Он член редколлегий журналов «Известия РАН. Серия биологическая», «Онтогенез», «Клеточные технологии в биологии и медицине», «Молекулярная медицина», член редакционного совета «Вестник Московского университета. Серия биология»
член Научного совета Минздрава России, Федерального учебно-методического объединения «Биологические науки», Научно-технического совета АО «Роснано».

Лауреат премии МАИК «Наука/Интерпериодика» (2006 г.).