Специалист в области цифровой фармакологии и фармацевтики, автор 376 научных работ, из них 29 глав в монографиях (включая монографии издательств Academic Press, Oxford, Springer, Taylor & Francis и Royal Society of Chemistry), 23 авторских свидетельств и патентов. 

Академик РАН c 30.05.2025 — Отделение медицинских наук (по специальности «фармация, фармакология»). 

Член-корреспондент РАН c 15.11.2019 — Отделение медицинских наук (секция медико-биологических наук).

Научные интересы

Среди его работ: 

• аналитический обзор «Фармацевтические исследования и разработки в России» (Research and Development in Russian Pharmaceuticals, SCRIP Russian Pharmaceutical Market Guide. PJB Publications, 1997); 
• посвящённые цифровой фармакологии разделы учебника для студентов вузов «Доклиническое изучение лекарственных средств (промышленная фармация)» (под ред. А.Л. Хохлова, Н.В. Пятигорской. М.: Из-во ООО «ГРУППА РЕМЕДИУМ», 2021); 
• «Репозиционирование лекарств для терапии COVID-19: Аналитические материалы в интересах (по заказам) органов государственной власти» (М.: ИБМХ, 2024). Индекс Хирша – 58 (Google Scholar), 43 (Scopus), 41 (Core Collection Web of Science), 43 (РИНЦ). Перечень публикаций на Google Scholar.

Работы созданной им научной школы по цифровой фармакологии внесли весомый вклад в разработку и практическое применение подходов к оценке in silico профилей биологической активности и других характеристик фармакологически активных веществ (ФАВ). 

Реализована технологическая платформа Way2Drug, содержащая 40 оригинальных информационных и вычислительных веб-ресурсов, В их числе, созданные впервые в мире: веб-сервис PASS Online, прогнозирующий несколько тысяч видов биологической активности; база данных WWAD по 4500 лекарственным препаратам, зарегистрированным в 80 странах мира; база данных Phyto4Health по фитокомпонентам лекарственных растений, включённых в Государственную фармакопею Российской Федерации; CLC-Pred — веб-сервис по оценке цитотоксичности лекарственно-подобных соединений по отношению к опухолевым и нормальным клеточным линиям; ADVERPred — веб-сервис по оценке побочного действия фармакологических веществ на сердечно-сосудистую и гепатобилиарную систему; и др.

Реализованные на платформе Way2Drug веб-ресурсы используются свыше 60 тысяч человек из 105 стран, включая более 13 тысяч исследователей из 205 учебных и научных учреждений РФ, с целью отбора наиболее перспективных соединений для химического синтеза и определения приоритетных направлений тестирования фармакологической активности.

С применением разработанных под его руководством методов цифровой фармакологии найдены новые фармакологические вещества, обладающие ноотропной, анксиолитической, антидиабетической, противоопухолевой, антимикробной и другими видами биологической активности, которые могут найти применение в медицине. ИПХЭТ СО РАН и НИИ ФиРМ имени Е.Д. Гольдберга завершены доклинические испытания оригинального ненаркотического анальгетика Тиовюрцина, найденного на основе прогноза спектров биологической активности с использованием программы PASS. В 2000 году в рамках Европейской инициативы Grand Challenge Against COVID-19 на основе виртуального скрининга свыше миллиарда химических соединений отобраны потенциальные ингибиторы SARS-CoV-2, активность которых подтверждена в эксперименте.

В течение 30 лет организует проведение инициированных академиком РАН А.И. Арчаковым ежегодных симпозиумов «Биоинформатика и компьютерное конструирование лекарств» (с 2020 года Symposium on Bioinformatics and Computer-Aided Drug Discovery проводится онлайн как международный).

Член бюро секции МБН ОМедН РАН, секции «Фармакология и фармация» Научного совета РАН «Науки о жизни», Научного совета по медицинской химии РАН; редколлегий журналов «Химико-фармацевтический журнал», «Биомедицинская химия», SAR and QSAR in Environmental Research, Biomedical Informatics, Big Data Mining and Analytics; учёных советов ИБМХ и ИФАВ РАН; диссертационных советов ДК 24.1.172.01 (зам. председателя), ДК 24.1.101.01 и ДК 24.1.139.01; член Совета по грантам Президента Российской Федерации; эксперт РАН, Минобрнауки, РНФ, РИНКЦЭ и фонда «Сколково».

Премии и награды

• Медаль ордена «За заслуги перед Отечеством» II степени, 2023 г.
• Юбилейная медаль «300 лет Российской академии наук», 2024 г.
• Почётная грамота Российской академии наук, 2021 г.
• Благодарность Оргкомитета Научной премии Сбера и Национального фонда подготовки кадров, 2021 г.
• Золотая медаль «100 лет профессору А.Н. Косту» Международного фонда «Научное партнёрство», 2015 г.
• Благодарность Министерства образования и науки РФ, 2013 г.
• Благодарность Оргкомитета Российского национального конгресса «Человек и лекарство», 2013 г.
• Диплом победителя конкурса «Авангард знаний» фирмы «АстраЗенека» , 2011 г.
• Благодарность РНИМУ им. Н. И. Пирогова, 2011 г.
• Золотой знак Международного фонда «Научное партнёрство», 2010 г.
• Медаль 850-летия Москвы, 1998 г.

Персональные профили исследователя

• Web of Science: O-2769-2013.
• Scopus: 7004294720.
• РИНЦ: 80992.
• ORCID: 0000-0001-7937-2621.