Основные научные интересы Буданцева Льва Юстиановича связаны с систематикой, историей, эволюцией и экологией ископаемых растений и палеофлор кайнофита России и зарубежных стран. Непременный участник, исполнитель и руководитель многих проектов РФФИ и программ Президиума РАН, участник отечественных и зарубежных конгрессов, конференций и совещаний; вице-президент Международного Ботанического конгресса в Сент-Луисе, США. Принимал участие в десятках научных экспедиций по России, странам ближнего и дальнего зарубежья, во время которых собрал большой коллекционный материал, включающий более 10000 образцов ископаемых растений и представителей современной флоры. Описал более 250 новых для науки таксонов вымерших растений.; Буданцев Лев Юстианович в настоящее время является научным руководителем лаборатории палеоботаники БИН РАН, членом Ученого совета, Диссертационного совета БИН РАН, председателем проблемного Совета по ботанике, членом редколлегий «Ботанического журнала», «Палеонтологического журнала» и ежегодника «Палеоботаника», членом Международного палеоботанического общества. Был научным руководителем 6 аспирантов и научных сотрудников, успешно защитивших кандидатские диссертации, научным консультантом докторской диссертации.; Автор более 100 научных работ, в том числе 6 монографий. Основные: Буданцев Л.Ю. История арктической флоры эпохи раннего кайнофита. Л.: Наука, 1983. 154 с.; Буданцев Л.Ю. Ранние этапы формирования и расселения умеренной флоры Бореальной области. Л.: Наука, 1986. 60 с.; Буданцев Л.Ю. Позднеэоценовая флора Западной Камчатки. Тр. БИН РАН. 1997. Вып. 19. 115 с.; Ископаемые цветковые растения России и сопредельных государств. Т. 4. Nyctaginaceae – Salicaceae / Ред. Л.Ю. Буданцев. М.: Товарищество научных изданий КМК, 2005. 466 с.; Буданцев Л.Ю. Раннепалеогеновая флора Западной Камчатки. Тр. БИН РАН. 2006. Вып. 22. 160 с.; Буданцев Л.Ю., Головнёва Л.Б. Палеогеновая флора Шпицбергена. СПб: Марафон, 2009. 400 с.; Буданцев Л.Ю. награжден медалью ордена «За заслуги перед Отечеством» 2-й степени. Удостоен премии им. В.Л. Комарова РАН (2008), премии Фонда Х. Раусинга (2010).; ; Ключевые слова; ; Систематика и морфология ископаемых растений. Палеофлористика, фитостратиграфия.
